9月18日，2012年全國衛生系統對口支援新疆工作座談會在新疆維吾爾自治區烏魯木齊市召開。衛生部扶貧開發與對口支援工作領導小組組長、衛生部黨組書記、副部長張茅在會上介紹，截至目前，各對口支援省(市)“十二五”衛生援疆專項規劃基本確定，規劃總投入46億元，支持項目257個，主要涵蓋醫療衛生機構基礎設施建設、醫療設備購置、衛生人才培養、衛生信息化建設等方面。

張茅介紹，新一輪衛生援疆工作分三階段推進。第一階段是打基礎，到2012年，初步在新疆建立起覆蓋城鄉居民的基本醫療衛生制度;第二階段是上水平，到2015年，新疆醫療衛生機構基礎設施明顯改善，衛生專業技術人員素質得到提高，醫療衛生服務能力明顯增強，居民主要健康指標達到西部地區中上水平;第三階段是大發展，到2020年，基本建立覆蓋城鄉居民的基本醫療衛生制度，實現新疆醫療衛生事業跨越式發展。

張茅指出，目前，衛生援疆“打基礎”工作任務已較好完成，今后一段時間要圍繞第二階段“上水平”目標，與深化醫改緊密結合，進一步健全醫療衛生服務體系。“十二五”期間，力爭實現全疆基層醫療衛生機構標準化建設達標率達到95%以上，使全疆每萬名城市居民擁有2名以上全科醫生，每個鄉鎮衛生院都有全科醫生;人均基本公共衛生服務經費標準達到40元以上，城鄉居民健康檔案規范化電子建檔率達到75%以上，在全疆形成統一指揮、布局合理的突發公共事件衛生應急體系。

據介紹，自2010年至今年6月底，各對口支援省(市)衛生廳(局)共派出援疆干部和衛生技術人員900余人，接收新疆管理干部掛職鍛煉和衛生人員進修培訓2000余人，開展專題培訓5萬余人次。自2011年至今，中央專項投資76.9億元，重點支持新疆維吾爾自治區和新疆生產建設兵團推進深化醫改等各項重點工作。協調安排資金近9000萬元應對新疆脊髓灰質炎輸入性疫情。